Durante la década de 1940, disputa palmo a palmo los campeonatos de 1942, 1943 y 1944, colocándose en esos tres años de forma consecutiva, en la tercera posición, perdiendo los títulos por detrás de Peñarol y Nacional.Comienzan a destacarse jugadores como Juan José Carvidón (debutó en 1933 y jugó hasta 1948, siendo golero de la selección uruguaya de 1941 a 1944) y Óscar Chelle, camiseta atletico de madrid segundo máximo goleador de la historia del club.
